胎儿磁共振检查是出生缺陷二级预防的重要手段，具有大范围成像、软组织分辨率高、无辐射、非侵入性等特点。
磁共振受母亲情况影响小，磁共振不受胎儿骨骼及羊水量影响，对胎儿中枢神经系统疾病、羊水过少和胸部疾病诊断方面具有较高优势。视野大，可显示胎儿全貌；磁共振能显示气道等特殊结构和小器官；磁共振切面标准、看得正。
一般20周后做比较好，20周前不推荐做，孕早期（12周前）禁止做。
产前超声怀疑异常但不能充分诊断时；产前超声阴性，但既往妊娠或直系亲属有严重发育异常家族史。
综上所述，精准磁共振检查联合产前超声检查，可提高胎儿畸形的产前诊断率，特别是在胎儿神经系统方面的检查更有优势。